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国家超级计算深圳中心

国家超级计算深圳中心(深圳云计算中心),简称深圳超算,总投资12.3亿元,一期建设用地面积1.2万平方米,总建筑面积4.3万平方米。
中文名
国家超级计算深圳中心
总投资
12.3亿元
总建筑面积
4.3万平方米
所属地区
深圳

目录

主机系统由中国科学院计算技术研究所研制、曙光信息产业(北京)有限公司制造,2010年5月经世界超级计算机组织实测确认,运算速度达每秒1271万亿次(峰值3000万亿次),排名世界第二 ,该项目是国家863计划、广东省和深圳市重大项目。

深圳超算系深圳市人民政府批准成立的企业化管理事业单位,下设:系统运行部、研究开发部、技术协作部、行政管理部,专业技术和管理人员90%具有硕士或博士学位,多数具有海外留学经历。

深圳超算立足深圳、面向全国、服务华南、港、澳、台及东南亚地区,将承担各种大规模科学计算和工程计算任务,同时以其强大的数据处理和存储能力为社会提供云计算服务,将建成功能齐全、平台丰富、高效节能、国际一流的高性能计算研究开发中心和云计算服务中心。

应用领域

深圳超算为企业和科研机构提供强大的计算资源,支持重大课题或者进行协作研发 。

应用领域覆盖:结构强度、动力学、运动学、碰撞安全、流体力学的工程计算、计算物理、计算化学、地球物理学、生物、气象、医药、运筹优化。

中心的专家团队提供全面的工程仿真与咨询服务,包括:结构强度分析、多体动力学运动仿真、计算流体力学分析、电磁分析、物流优化、企业级仿真流程与数据管理系统。同时在科学计算领域开展各种合作研究。

基本环境

深圳超算采用由中科院和曙光公司联合研制的曙光6000超级计算系统,该系统整体计算能力实测峰值为1.271千万亿次浮点运算(1.271PFLOPS)。于2011年11月16日投入运行。

为了方便管理和使用,曙光6000超级计算系统高性能计算区分成5个逻辑分区,分别为科学计算分区(GK)、工程计算分区(GG)、生命科学计算(GS)、胖节点分区(Fn)以及龙芯计算分区(Lx)。

其中GK、GG、GS分区的每个计算节点由2颗Intel5650六核心处理器组成、主频2.66GHz,配置24GBDDR3内存以及1块Nvidia C2050 GPGPU卡,一块本地2.5 SAS硬盘,一块QDRIB子卡。胖节点分区(Fn)共配臵128台4路A840 SMP计算节点,每个计算节点配臵4颗AMD 6136八核心处理,主频2.4GHz,内存128GB。龙芯分区(Lx)共配臵320台龙芯节点,每个节点配臵1颗AMD64双核CPU和8颗龙芯处理器,20G内存,1块DDRIB网卡。

曙光6000超级计算主机系统的存储分为两种:每个计算节点配备的本地磁盘;由存储节点建立的高速并行文件系统。其中本地硬盘严禁普通用户使用,仅供计算节点操作系统使用,用户的所有操作都应该在账号所对应的$HOME(该$HOME所在的位臵为高速并行文件系统)下进行,用户登录时,会自动被引导到自己账号的$HOME下面。鉴于存储空间的有限和数据安全的考虑,请用户务必做到及时下载计算结果文件并清理空间。

用户可以使用VPN进入登录节点,该登录节点主要用于登录超算内网、使用LSF作业调度系统提交作业,禁止在登录节点运行程序、编译及数据上传下载。

软件环境

1. 操作系统 

计算节点和前端接入节点的操作系统均为64位SuSE Linux EnterpriseServer(SLES)11SP1,提供标准的64位Linux操作系统环境。用户需要事先适当熟悉一些基本的Linux命令行操作,特别是文件目录操作,并能熟练使用一种编辑器(vi或emacs等)。

2. 作业调度系统

大规模超级计算系统,为了有效利用众多处理器核心所提供的计算能力,需要有一个作业管理系统,统一地跟用户交互,接收提交的各类计算任务,合理分配计算资源,将用户作业指派到具体的节点执行,对用户来说,不需要关心计算具体在哪里进行的,系统会自动按照最优化原则进行调度,这不仅方便了用户的使用,更提高了整个系统的利用率。作业管理系统是整个超级计算机最重要的软件环境之一,目前在曙光6000超级计算机上使用的作业管理系统是Platform公司的LSF(LoadSharing Facility)作业管理系统。

3. 编译器和并行实现

曙光6000主机系统支持OpenMP和MPI两种并行方式。OpenMP为共享内存方式,仅能在一个计算节点内并行,最大线程数不能超过该节点处理器核心数(GS/GG/GK分区为12,Fn分区为32)。MPI则是分布式内存并行,计算作业可以在一个或者若干个节点上进行,最大进程数仅受用户账号所能调用的CPU总数限制。目前常见的支持InfiniBand网络的MPI实现是MVAPICH/MVAPICH2和OpenMPI。

4. 数学库

开放源代码程序往往要调用大量的数学函数进行各种计算,经过长期积累,已经有一些比较成熟的标准化数学库,其中最常见的诸如线性代数方面的BLAS、LAPACK、ScaLAPACK和快速傅里叶变换FFT等等。

其他

“超算中心”计算能力超20万台电脑

何谓超级计算中心?深圳及有关部委合力共建的这一深圳超算中心,究竟有何“超级作用”?有关专家表示,筹建中的国家超级计算深圳中心与一般计算机相比,其计算能力惊人,将超过20万台普通笔记本电脑的计算能力。

据市科工贸信委有关人士介绍,超级计算中心是以超级计算机为基础,面向科研、国民经济、社会发展、高新技术产业等突出问题和核心技术,是着重对准解决普通计算机和服务器不能完成的大型复杂课题而建设的,相对于早期的计算中心而言,它的计算能力有了巨大的飞跃,可应用的领域和使用模式更有了极大的拓展。超级计算中心是建立在足够的科技创新能力和应用需求基础上的,是一个国家和地区的自主创新能力和综合竞争力的具体体现。

“超算中心”的计算能力惊人,比如:用一台普通电脑分析30年的气象数据需要20多年,而使用这台千万亿次超级计算机只需1小时;使用一台普通的电脑需要1年才能完成一次汽车碰撞模拟实验,而这台超级计算机不到15分钟就可以完成。超级计算机主要用在:新能源、新材料、自然灾害、气象预报、地质勘探、工业仿真模拟、新药开发、动漫制作,基因排序、城市规划等等。

“超算中心”对民生发展也有举足轻重不可替代的作用,譬如外地的空气污染是否会影响到深圳?印度尼西亚的海啸对珠三角有什么影响?等等这些都可以用超级计算机找到答案。此外,超级计算机应用的网格计算技术可以通过互联网来共享强大的计算能力和数据储存能力。

国家发改委召开国家创新能力建设和国家信息化试点授牌表彰大会

深圳获电子商务示范城市授牌

昨天下午,国家发展改革委在会展中心召开国家创新能力建设和国家信息化试点授牌表彰大会,深圳获我国首个电子商务示范城市授牌。

昨天的授牌表彰大会,对我国首个电子商务电子示范城市深圳、第十六批83家国家认定企业技术中心、51家新建的国家工程实验室、26家国家地方联合工程研究中心、18家国家地方联合工程实验室、106个国家信息化试点工程进行授牌,对50家获得国家认定企业技术中心成就奖的单位、93名获得国家创新能力建设先进工作者的个人进行表彰。此次进行授牌的项目主要涉及四个方面:一是为强化企业自主创新的组织体系,促进提升企业技术创新能力,新认定的国家认定企业技术中心;二是为完善国家技术创新体系,建立产业核心技术的试验系统,新批复设立的国家工程实验室;三是为促进完善区域创新体系,支撑和推动地方经济又好又快发展,国家发改委与有关省市联合建设的国家地方联合工程研究中心和联合工程实验室;四是为培育信息服务新模式,探索政企合作新机制,实施的国家信息化试点项目和深圳市建设国家电子商务示范城市。

中科院和深圳市政府之间的“院市合作”再获新突破。昨日下午,位居世界前列、每秒运算能力将达每秒千万亿次的“国家超级计算深圳中心”,在深圳会展中心隆重举行启动仪式。据悉,目前该中心各项前期准备工作已完成,开工建设后将在明年高交会期间投入运行。

作为深圳建市以来最大的国家级重大科技基础设施,“超算中心”将由中国科学院、深圳市政府共同建设。超算中心选址深圳西丽大学城,规划用地2.5万平方米,项目总投资约8亿元,其中国家投资2亿元,深圳市政府配套投资约6亿元。该中心对促进我国高性能计算和提升深圳自主创新能力及国际竞争能力,将起到重要的“推进器”作用。

中国科学院副院长施尔畏,科技部高新产业司长冯记春,广东省委副书记、深圳市委书记刘玉浦,广东省委常委、深圳市代市长王荣,深圳市委常委、常务副市长许勤出席了仪式,市政府秘书长李平主持仪式。

据悉,我国有关部委高度重视深圳超算中心的建设,并已将中心建设列入《珠江三角洲地区改革发展规划纲要》。广东省委省政府和深圳市委市政府更把超算中心的建设,作为落实《深圳市综合配套改革总体方案》的重要举措之一,要求各有关部门全力支持超算中心的筹建工作。经过一年多的筹备工作,超算中心现已完成地质勘探、环境评估和方案设计等工作,将在明年高交会期间投入运行。

国家超级计算中心落户深圳,背后依据的是深圳及华南地区对超级计算的巨大需求。据介绍,华南地区作为我国经济最发达和活跃的一个区域,经济总量占全国的六分之一。目前,华南地区在产业、科研和公共服务方面对高性能计算需求非常旺盛。据2008年调研结果表明,华南地区对高性能计算需求总量峰值达1600万亿次以上,其中深圳有超过800万亿次的计算需求,此外港、澳、台及东南亚地区也有300亿次以上的计算需求。深圳超算中心的建设,将有力弥补华南高性能计算基础设施长期薄弱的“短板”,并成为深圳建设创新型城市的“超级助推器”。

王荣代表深圳市委市政府,对科技部、中科院等国家有关部门长期以来给与深圳市的大力支持,表示衷心的感谢。他说,加快研制具有世界先进计算理论与方法、浮点运算能力每秒超千万亿次的新一代超级计算机,是我国科技战略的重大部署,对于提高我国超级计算机研制的水平,增强国家在尖端科技领域的核心竞争力等,均具有重大意义。国家超级计算中心项目落户深圳,是国家赋予深圳的重大历史使命,必将有力地推动深圳建设国家创新型城市的步伐,直接增强华南地区的整体科技实力,对优化国家科技布局,建设创新型国家产生深远的影响。深圳市委市政府高度重视国家超级计算深圳中心的建设,将高水平、高标准地为项目建设提供政策、资金和基础设施等各种条件支持,全力以赴把国家超级计算深圳中心建设好、管理好、运营好,力争把国家超级计算深圳中心打造成深圳又一新的重要创新标志和闪亮的城市名片,为建设创新型国家做出更大贡献。

如今,超级计算中心已经于10年4月开始投入紧张的建设施工过程中,深圳市将其定为国家重大应急项目,并督促施工单位24小时施工作业,政府其他部门予以全力配合,以使该中心尽快投入使用,使之服务于社会。

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