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王秀杰

1998年获南开大学生物学专业学士学位, 2000年获香港科技大学生物化学专业硕士学位, 2004年6月获洛克菲勒大学 (The Rockefeller University) 生物信息学专业博士学位, 同年在洛克菲勒大学从事博士后研究。2004年12月加入中国科学院遗传与发育生物学研究所。入选中科院“百人计划”。现任国家重大科学研究计划项目首席科学家。担任 RNA Biology, BMC Genomics, Journal of Genetics and Genomics 等杂志编委。

目录

1998年获南开大学生物学专业学士学位, 2000年获香港科技大学生物化学专业硕士学位, 2004年6月获洛克菲勒大学 (The Rockefeller University) 生物信息学专业博士学位, 同年在洛克菲勒大学从事博士后研究。2004年12月加入中国科学院遗传与发育生物学研究所。入选中科院“百人计划”。

现任国家重大科学研究计划项目首席科学家。担任 RNA Biology, BMC Genomics, Journal of Genetics and Genomics 等杂志编委。兼任第十二届中华青年全国联合会科学技术界别工作委员会副主任委员、第五届中国青年科技工作者协会常务理事、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会副会长等职务。

研究方向

研究方向为生物信息学和系统生物学,重点关注非编码RNA和表观遗传修饰相关的功能与机制。

近期研究重点

1.非编码RNA与表观遗传修饰在哺乳动物胚胎干细胞多能性调控中的功能与机制研究

利用新一代高通量测序技术,发现对哺乳动物胚胎干细胞多能性的获得与维持具有重要调控作用的microRNA、lncRNA等非编码RNA并研究部分非编码RNA的作用机制,研究RNA甲基化等表观遗传修饰对哺乳动物胚胎干细胞多能性的影响与机理。

2.细胞分化与组织器官形成的调控机制研究

整合各种高通量测序数据,解析哺乳动物细胞分化与主要组织器官形成的调控网络,挖掘调控哺乳动物细胞分化与主要组织器官形成的关键因子。

3. 生物信息学算法和软件的开发

已开发软件

GOEAST (Gene Ontology Enrichment Analysis Software Toolkit)

https://omicslab.genetics.ac.cn/GOEAST/

psRobot (Plant Small RNA Analysis Toolbox)

https://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/

ISRNA (Integrative Short Reads NAvigator)

https://omicslab.genetics.ac.cn/ISRNA/

奖励与荣誉

2016年       入选中组部“万人计划领军人才”

2016年       国家自然科学奖二等奖 (排名第四)

2016年       高等学校科学研究优秀成果自然科学奖一等奖 (排名第七)

2016年       “中源协和生命医学奖”创新突破奖

2016年       中国科学院“优秀研究生指导教师奖”

2015年      “全国五一巾帼标兵”荣誉称号

2015年      “全国三八红旗集体”荣誉称号

2014年       入选科技部“中青年科技创新领军人才”

2014 年       国家自然科学奖二等奖(排名第二)

2014年      中国科学院京区“巾帼建功”先进集体奖

2013年      “中国青年五四奖章”荣誉称号

2013 年      中国科学院“杰出科技成就奖”集体奖

2012 年     “全国青年岗位能手”荣誉称号

2012年      中央国家机关青年“五四奖章标兵”荣誉称号

2007 年      杜邦青年科学家奖

2007 年      国家杰出青年科学基金

学术著作

截止2013年6月10日,Google scholar检索显示,己发表论文(包括合作论文)共80篇,引用2841次,引用大于10次的文章39篇。具体文章列表可访问遗传发育所研究队伍成员介绍或用Google school/Web of Knowledge联合检索作者姓名及单位。

近三年部分优秀文章推荐

Wu HJ, Wang ZM, Wang M andWang XJ*. (2013) Wide-spread long non-coding RNAs (lncRNAs) as endogenous target mimics (eTMs) for microRNAs in plants.Plant Physiology161:1875-84.2.

Ling HQ, Zhao S, Liu D, Wang J, Sun H, Zhang C, Fan H, Li D, Dong L, Tao Y, Gao C, Wu H, Li Y, Cui Y, Guo X, Zheng S, Wang B, Yu K, Liang Q, Yang W, Lou X, Chen J, Feng M, Jian J, Zhang X, Luo G, Jiang Y, Liu J, Wang Z, Sha Y, Zhang B, Wu H, Tang D, Shen Q, Xue P, Zou S,Wang X, Liu X, Wang F, Yang Y, An X, Dong Z, Zhang K, Zhang X, Luo MC, Dvorak J, Tong Y, Wang J, Yang H, Li Z, Wang D, Zhang A, Wang J. (2013) Draft genome of the wheat A-genomeTriticum urartu.Nature496:87-90.

Li RC, Tao J, Guo YB, WU HD, Liu RF, Bai Y, Lv ZZ, Luo GZ, Li LL, Wang M, Yang HQ, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ, Xu M* and Wang SQ*. (2013) In vivo suppression of microRNA-24 prevents the transition toward decompensated hypertrophy in aortic-constricted mice.Circulation Research112: 601-605.

Zheng G, Dahl JA, Niu Y, Fedorcsak P, Huang CM, Li CJ, Vagbo CB, Shi Y, Wang WL, Song SH, Lu Z, Bosmans RP, Dai Q, Hao YJ, Yang X, Zhao WM, Tong WM,Wang XJ, Bogdan F, Furu K, Fu Y, Jia G, Zhao X, Liu J, Krokan HE, Klungland A, Yang YG* and He C*. ALKBH5 is a mammalian RNA demethylase that impacts RNA metabolism and mouse fertility.Molecular Cell10: 18-29.

Li W, Shuai L, Wan H, Dong M, Wang M, Sang L, Feng C, Luo GZ, Li T, Li X, Wang L, Zheng QY, Sheng C, Wu HJ, Liu Z, Liu L, Wang L,Wang XJ, Zhao XY* and Zhou Q*. (2012) Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice.Nature490:407-411.

Xu M, Wu HD, Li RC, Zhang HB, Wang M, Tao J, Feng XH, Guo YB, Li SF, Lai ST, Zhou P, Li LL, Yang HQ, Luo GZ, Bai Y,Xi J, Gao W, Han QD, Zhang YY,Wang XJ*, Meng X and Wang SQ*. (2012) Mir-24 regulates Junctophilin-2 expression in cardiomyocytes.Circulation Research111:837-841. (*co-corresponding author)

Wu HJ, Zhang Z, Wang J, Oh DH, DAssanayake M, Liu B, Huang Q, Sun HX, Xia R, Wu Y, Wang Y, Yang Z, Liu Y, Zhang W, Zhang H, Chu J, Yan C, Fang S, Zhang J, Wang Y, Zhang F, Wang G, Lee SY, Cheeseman JM, Yang B, Li B, Ming J, Yang L, Wang J, Chu C*, Chen S*, Bohert HJ, Zhu JK*,Wang XJ*and Xie Q*. (2012) Insights into salt tolerance from the genome ofThellungislla salsuginea.Proc. Natl. Acad. Sci. USA109: 12219-12224. (*co-corresponding author)

Wu HJ, Ma YK, Chen T, Wang M andWang XJ*. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox.Nucleic Acids Research40:W22-W28.

Zhao YT, Wang M, Fu SX, Yang WC, Qi CK andWang XJ*. (2012) Small RNA profiling in twoBrAssica napuscultivars identifies microRNAs with oil production and developmental correlated expressions and new small RNA clAsses.Plant Physiology158:813-823.

Sheng C, Zheng QY, Wu JY, Xu Z, Wang LB, Li W, Zhang HJ, Zhao XY, Liu L, Wang ZW, Guo CL, Wu HJ, Liu ZH, Wang L, He SG,Wang XJ, Chen ZG and Zhou Q. (2012) Direct reprogramming of sertoli cells into multipotent neural stem cells by defiend factors.Cell Research22:208-218.

Wang H, Zhang X, Liu J, Kiba T, Woo J, Ojo T, Hafner M, Tuschl T, Chua NH* andWang XJ*.(2011) Deep sequencing of small RNAs specifically Associated with Arabidopsis AGO1 and AGO4 uncovers new AGO functions.The Plant Journal67:292-304.

Li W, Zhao XY, Wan HF, Zhang Y, Liu L, Zhuo L,Wang XJ, Wang L and Zhou Q. (2011) iPS cells generated without c-Myc have activeDlk1-Dio3region and are capable of producing full-term mice through tetraploid complementation.Cell Research21:550-553.

Tong M, Lv Z, Liu L, Zhu H, Zheng QY, Zhao XY, Li W, Wu YB, Zhang HJ, Wu HJ, Li ZK, Zeng FY, Wang L,WangXJ, Sha JH and Zhou Q. (2011) Mice generated from tetraploid complementation competent iPS cells show similar developmental features as those from ES cells but are prone to tumorigenesis.Cell Research21: 1634-1637.

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