伏见天皇

他即位后不久，宫中突发谋刺天皇的事件。伏见天皇因得到宫女的密报，男扮女装逃走，躲过一劫。事后人们得知，此事与大觉寺一派有些瓜葛，更有人说就是龟山上皇和后宇多上皇的指使。如此一来，反而使后深草上皇的持明院派系统在政治上居于主动地位，后深草上皇乘机复出主持院政。其实，这时的天皇已毫无权力，可毕竟还是日本国民的最高精神权威，名义上的最高统治者，所以，后嵯峨的儿子--后深草天皇和龟山天皇兄弟二人仍是互相争夺不已。

在幕府的支持下，后深草上皇施行院政。后深草上皇知恩图报，极力迎合幕府的旨意，派皇子久明亲王为将军，去镰仓加强和幕府之间的联系。1289年，又立伏见天皇的儿子胤仁亲王为太子。这样，后深草的一支又压过了龟山一支，在皇位继承上，占了主导地位。后深草上皇把自家的事情安排妥当后，才放心去空门修行，真可谓是无后顾之忧了。

龟山上皇见后深草上皇占了上风，也故伎重演以出家为要挟，于是，1298年，伏见天皇退位，胤仁太子继位为后伏见天皇。