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国家基因库

2011年01月,国家发改委批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库(China National Genebank,CNGB)。同年10月,国家基因库建设方案由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、国家卫生和计划生育委员会四部委批复。国家基因库基地位于深圳市大鹏新区大鹏街道下沙片区“禾塘仔”地块,计划建设总规模约116000平米,分两期建成。其中,一期建筑面积47500平方米。2016年9月22日,中国首个国家基因库正式开幕。这是全球继美国国家生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA数据库(DDBJ)之外的第四大基因库,也是全球最大的综合性基因库。

目录

国家基因库计划建成国际一流水平的高效基因信息数据库、可溯源性生物样本资源库,制定基因信息数据和生物样本采集、储存和管理相关标准和技术规范;通过国际、国家行业高标准,参与国际、国内联盟合作,发挥互补性优势,围绕生物医药、生物农业和海洋生物等生物产业重点领域搭建基因资源挖掘的基础性支撑平台;保护我国珍贵且特有的遗传资源,实现基因及数据资源共享利用,提高我国基因组数据的储存、分析和管理能力,进而推动生命科学和生物产业发展,把握未来生物经济的战略优势,充分保护和利用我国基因战略资源。

国家基因库建筑效果图国家基因库建筑效果图

国家基因库采用基因信息数据库和生物样本资源库相结合的建设模式,以“存、读、懂、写、用”为建设目标,打造既有数据又有可溯源实体样本的新一代基因资源库、信息库、知识库和工具库。旨在保护我国珍贵且特有的遗传资源,实现基因及数据资源共享利用,提高我国基因组数据的储存、分析和管理能力,进而推动生命科学和生物产业发展,对于抢占未来生物经济的战略制高点、掌控基因战略资源,具有极其重要的战略意义。

丰富的生物资源

生物资源库包括人类和非人两种资源类型,其中非人资源方向包括动物细胞资源、植物种质资源、微生物资源和海洋资源四大类型。通过收集人和非人两个方向的不同来源和形式的资源样本(动、植物活体细胞,微生物菌株,人类组织细胞,重要濒危物种,血液和小分子等),形成大规模、高质量、规范化的样本资源库。确保我国生物资源尤其是我国的特有物种、濒危物种、具有重要经济价值和科学研究价值的物种以及生态系统物种种群的安全性,有效的保护我国生物资源的多样性,可持续利用生物资源,为人类社会可持续发展提供物质基础。

生命伦理委员会

国家基因库生命伦理委员会是深圳国家基因库负责生命科学伦理审查、管理、指导与咨询工作的常设独立机构。它由来自伦理学、法学、社会学、生物学、医学等多学科专家和社会人士共同组成。其宗旨是通过伦理审查与管理、确保利益相关者的尊严、安全和权益得到保护,并为联盟成员或其它单位及个人提供伦理指导与咨询,增强公众对国家基因库工作的信任和支持,使其有效的服务于人类社会。

国家基因库生命伦理委员会将严格依据中国法律、法规、规章和国际准则审查项目,遵循“尊重、不伤害、有利及公正”的生命伦理原则,独立透明开展伦理工作。

综合性世界最强

中国的基因库建设比多数发达国家晚几十年,国家基因库是继美国国家生物技术信息中心(NCBI)、欧洲生物信息研究所(EBI)、日本DNA数据库(DDBJ)之后,全球第四个国家级基因库。

但中国国家基因库具有其他三国尚未具备的功能。除了和其他国家一样的数据库功能外,国家基因库还有样品库和活体库。

国家基因库分两期建设,首先开幕的是一期,工程投资7.8亿元,建筑面积4.75万平方米,基因信息数据总量达60PB,生物样本存储能力1000万份。

从架构来看,国家基因库将打造“三库两平台”,三库由生物信息数据库、生物样本资源库和生物活体库组成,两平台为数字化平台及合成与基因编辑平台。

生物活体库是全球第一个为生物多样性研究和保护提供资源的平台,包含重要物种保护和繁育技术,从水生物拓展至动植物和微生物等,并建立了医学健康基地。

大事记

2016年
09月22日,中国国家基因库正式运营。

2015年

02月03日,国家发展改革委高技术产业司副司长任志武、财政部经济建设司副司长王小龙、国家发展改革委高技术产业司新兴产业二处处长谭遂、财政部经济建设司工信处处长曲富国、国家发展改革委高技术产业司新兴产业二处黄建军一行来访华大基因,调研国家基因库项目进展,对国家基因库近几年的建设成果给予了高度肯定,并表示国家将给予更多关心和支持,希望国家基因库走出一条利国利民的全新道路。

02月06日,由深圳市市场监督管理局组织制订、深圳华大基因研究院(国家基因库)编写的深圳市标准化指导性技术文件《人类间充质干细胞库建设与管理规范》(编号:SZDB/Z 126-2015)正式发布,于2015年03月01日起实施。

02月28日,由深圳市市场监督管理局组织、深圳华大基因研究院(国家基因库)编写的深圳市标准化指导性技术文件《植物种质资源离体保存库建设规范》(编号:SZDB/Z 130-2015)正式发布,于2015年03月01日起开始实施。

03月02日,孟加拉国政府访问团到访国家基因库,希望能与国家基因库保持密切联系和沟通,进一步深入学习我国国家基因库的建设和发展经验。

03月03日,来自中科院昆明动物所和国家基因库的研究人员成功破译了高山倭蛙基因组,这是迄今为止破译的首个现代蛙类基因组,为两栖动物进化研究提供了新线索。相关研究成果在美国科学院院刊(PNAS)杂志在线发表。

2014年

01月23日,由深圳市市场监督管理局组织制订、由深圳华大基因研究院(国家基因库)和深圳市标准技术研究院联合编写的深圳市标准化指导性技术文件《动物种质资源库建设与管理规范》(编号:SZDB/Z 89-2014)、《人类样本库建设与管理规范》(编号:SZDB/Z 91-2014)及《生物基因信息数据库建设与管理规范》(编号:SZDB/Z 92-2014)(以下简称三个规范)正式发布。三个规范自2014年2月1日起实施。

02月02日,来自国家基因库等单位的科研人员成功破译了迄今为止首个比目鱼——半滑舌鳎全基因组序列图谱,揭示了半滑舌鳎性染色体起源机制和比目鱼底栖适应的分子机制,该成果于2014年2月2日发表在《自然•遗传》(Nature Genetics)上,国家基因库成员为共同第一作者及共同通讯作者。

03月,国家基因库已完成21项关于生物样本收集、处理和保存方面的专利申请工作,其中9项获得中华人民共和国知识产权局的授权。

04月,国家基因库-基因信息数据库宣布将面向全国提供生物数据免费存储服务,并确保储存信息的私密性和安全性,以进一步支持生物数据展示及分析等工作。

05月,国家基因库专家成功申请成为ISO/TC 276/WG2 联合召集人。

05月20日,首个白蚁基因组被成功破译,为社会性昆虫进化研究提供新线索。相关文章发布于国际期刊《自然·通讯》,国家基因库成员为共同第一作者。

06月,3项国际标准提案(PWI1:The collection, processing, conserving and transportation criteria for Human Genetic Resources;PWI2:The collection, processing, storage and transportation technology criteria for animal germplasm;PWI3:Methods to evaluate the quality of the mAssive sequencing data.)通过PWI投票(预提案投票),并正式纳入ISO/TC276工作中。

08月20日,国家基因库生物多样性组成员获得中国青少年科技创新奖。

08月21日,E-BioBank信息共享平台二期搭建完成,丰富了样本定位和项目资源量两大功能模块。

09月,国标委批准基因库提交的国家标准《核酸数据库格式规范》立项。

09月,华大基因和全球农作物多样化信托基金签订框架合作协议,今后国家基因库将在资源收集、农业生物多样性种质保护等方面与全球农作物多样化信托基金进行合作。

09月30日,包含来自国家国家基因库的研究人员首次成功绘制蚂蚁RNA编辑图谱,阐述了RNA编辑对蚂蚁行为分化的调控作用,该成果文章《切叶蚁等级特异的RNA编辑组》(Caste-specific RNA editomes in the leaf-cutting ant Acromyrmex echinatior)在《自然• 通讯》(Nature Communications)上公开发表,国家基因库成员为共同第一作者及共同通讯作者。

10月,国标委批复由国家基因库专家申请的ISO/TC 276的第三届年会(2015)在华大基因举办。

10月17日,北京重大疾病临床数据和样本资源库与深圳国家基因库联手,共同打造世界级样本库联盟。

11月7日,由国家基因库领衔的昆虫演化研究——千种昆虫转录组项目取得重大成果。并在《科学》杂志上发布相关文章。

11月7日,由国家基因库主办的中国人类遗传资源共享体系研讨会(即E-BioBank Face to Face Meeting)在中国深圳顺利召开。

12月,深圳国家基因库研究人员领衔的国际团队完成世界首个两栖鱼类基因组测序,相关研究成果于2014年12月2日发表在《自然·通讯》杂志上。

12月12日,国际鸟类基因组研究联盟于在Science等其他杂志上以专刊形式集中公布了28篇首期研究成果。来自世界上20多个国家,80多家机构包括国家基因库相关研究人员共计200多名科学家参与了这一研究项目。

12月29日,基因库建设工程结构封顶,基因库的主体结构工程顺利完成。

2013年

01月,国家基因库加入 Global Genome Biodiversity Network(GGBN)。

03月,筹建国家基因库出生缺陷联盟。

06月28日,国家基因库基地建设正式动工。

07月,中国首个出生缺陷联盟-国家基因库出生缺陷联盟正式成立。

09月,国家基因库副主管张国捷博士因在动物遗传学和比较基因组学研究上取得的成绩和做出的突出贡献,荣获第十四届“李汝祺动物遗传奖”。

10月,国家基因库与BioStorage Technologies签署战略联盟协议。

11月,国家基因库正式启动具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome,Fish T1K)。

2012年

03月,国家基因库建设项目与深圳其他九个创新性项目举行集体开工仪式。

05月,国家基因库已同10余家国内外知名科研院所达成战略合作伙伴关系,同时样本库目前已收集组织、血液、细胞、体液等各类型样本达百万余份。

09月,国家基因库同美国自然历史博物馆签订战略合作框架协议。

10月,国家基因库与广州医学院第一附属医院、呼吸病国家重点实验室共同发起组建“国家基因库-肺癌联盟”,来自全国各地的二十多家三级甲等医院加入了这一联盟。

10月,国家基因库基地取得中华人民共和国建筑工程施工许可证。

11月,同上海闵行区疾控中心合作成立“国家基因库—闵行区人群生物样本联合库”,开展大型人群队列研究。

12月,国家基因库-生物多样性联盟启动,已有国内外十余家单位加入。

12月,已有国内60多家与国际9家机构加入国家基因库联盟,共同推进我国生物样本库及转化医学的发展。

2011年

01月,国家发改委批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库。

06月,国家发改委副主任张晓强、时任广东省常务副省长朱小丹在第五届生物产业大会上为“国家基因库”揭牌。

10月,国家基因库建设方案获得国家发展改革委、财政部、工业和信息化部以及国家卫生和计划生育委员会四部委批复,相关项目列入国家战略性新兴产业发展专项资金计划。


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